结核分枝杆菌复合体的生态和演化出

过去 200 年，有 10 亿人因肺胃癌（TB）而幸存者。 直到从前，肺胃癌即没多久如此是遭受幸存者人数最多的传染病，WTO 有达每年有 1040 万新发肺胃癌病患上，每年有 170 万人因肺胃癌而幸存者。此外，研究成果技术人员有达亚太地区四分之一的人仍未被胃癌杆菌潜伏细杆菌感染，从而视为潜在稍微肺胃癌病患上。现今顾虑亚太地区肺胃癌相适应的障碍有三个：1) 肺胃癌的病症在很大以往上即没多久如此比如说 120 之前所技术开发的、更高准确度的涂片光学仪器核查技术；2) 肺胃癌的预防即没多久如此比如说 100 之前所技术开发的、视觉效果依赖于的卡介苗（Bacille Calmette-Guérin， BCG）；3) 肺胃癌的疗程即没多久如此比如说有数 40 至 60 年历史、治果依赖于，并且流感病毒愈发严重的抗病毒。在这一氛围下，多重适合于性（multiple-drug resistance， MDR）和广泛应用适合于性（extensive-drug resistance， XDR）肺胃癌已视为日益严重的问题。另外，肺胃癌拆分 HIV 细杆菌感染和肺胃癌拆分 2 改进型糖尿病等也都助宽了肺胃癌肆虐。除了不切实际的病症、预防和疗程应用软件外，各种反动也顾虑了肺胃癌领域的演进。例如，一些研究团队显然耐药性胃癌杆菌对机体的适于于性不如药品适合于生物学；一些论者显然胃癌杆菌作为一个种群，各不相同生物学两者之在在并不共有存RNA改进型和环境因素的药剂内。生物学肺胃癌主要由胃癌分枝芽孢复合物（Mycobacterium tuberculosis complex， MTBC）的领导者激起。MTBC 是一组基因组关联性并不高（> 99% 的核苷酸基因组确实性）的抗酸芽孢。与其它大肠芽孢比起，MTBC 领导者在在完均没有人基因组药剂内，所以多启动子基因组分改进型的用处依赖于，因此 MTBC 领导者两者之在在的生物学学和形态关连仍有待有利于揭示。新一代基因组技术的演进可让我们解决问题以往方法的局限性，在均基因组素质上观察 MTBC 领导者大肠芽孢的丰富性，从而详细统计分析 MTBC 领导者大肠芽孢丰富性的形态推动意志力。1. 分枝芽孢的遗传学家分枝芽孢科（Mycobacterium）下有 170 多种大肠芽孢，其之前大多数是自然环境生物学。通常，分枝芽孢科内的大肠芽孢可被细分慢速生宽杆菌（fast-growers）和速度慢生宽杆菌（slow-growers），其之前可细杆菌感染生物学的三种分枝芽孢杆菌类，以外 MTBC、非典改进型分枝芽孢（Mycobacterium leprae）和溃疡分枝芽孢（Mycobacterium ulcerans）科于速度慢生宽杆菌。此外，一些所谓的非胃癌分枝芽孢（non-tuberculous mycobacteria， NTM）可以所致自体意志力更高下或自体损害的人患病，这些芽孢以外慢速生宽的脓肿分枝芽孢（Mycobacterium abscessus）和速度慢生宽的鸟分枝芽孢（Mycobacterium ium）、海分枝芽孢（Mycobacterium marinum）、蟒蛇分枝芽孢（Mycobacterium xenopi）、戈氏分枝芽孢（Mycobacterium gordonae）和肯塔基分枝芽孢（Mycobacterium kansasii）。然而，适于于了生物学的 MTBC 是一类独具的大肠芽孢性。作营生物学的专性大肠芽孢性，这种 MTBC 并没有人任何自然环境细杆菌或爬虫类细杆菌，只不过比如说人—人传播者。与其它杆菌类各不相同的是，它们的毒意志力和传播者意志力并无建立保持联系。MTBC 是如何形态为如此成功的杆菌类的呢？1.1 从自然环境生物学到专性大肠芽孢性现今的论者是 MTBC 通过不断适于于线粒体内自然环境，逐步从自然环境生物学形态为专性大肠芽孢性。该形态处理过程的一个关键步骤是 MTBC 的起源于赢得了在原生爬虫类肝线粒体幸存的能意志力，这样胃癌杆菌没多久可有利于细杆菌感染哺乳爬虫类的巨噬线粒体并在其之前摄食。另一个关键的形态步骤是赢得了人徒弟的能意志力。当生物学患上肺胃癌后，细杆菌HIV呼吸困难造出的热空气飞沫没多久可所致胃癌杆菌的传播者。在原始社才会，生物学篝火社交以及因烟所所致的肺部损害也许在肺胃癌传播者和形态处理过程之前起到促进发挥作用。所致 MTBC 的起源于生物学转变为专性大肠芽孢性的发挥改进型停滞性是什么？非胃癌分枝芽孢之前的 M.marinum 和 M. kansasii 与 MTBC 在基因组素质上相尤其较高的关联性。将它们与 MTBC 的基因组积极开展尤其研究成果后，研究成果技术人员注意到 MTBC 删除了一些但会的RNA，例如与传染病无关的RNA；并且通过素质RNA移往（HGT）赢得了新RNA。MTBC 的基因组宽度是 4.4 Mb，多于 M. marinum 和 M. kansasii 的基因组（分别为 6.6 Mb 和 6.4 Mb）。同时，MTBC 的起源于自从和 M. marinum 和 M. kansasii 在形态上分离造出来后，通过 HGT 又赢得了数百个RNA，其之前以外移往酶RNA以及与适于于厌氧前提条件涉及的RNA。让研究团队困惑的是，这一结果还注意到 MTBC 的许多已知毒意志力因姪在 NTM 的基因组之前也共有存，如 PhoPR 双组分管理系统、DosR / S / T 调节姪、mce 涉及RNA和 ESAT6 新陈代谢管理系统。比方说的两类虽然基本功能未被注意到，但被预见与传染病和胞内幸存有关的RNA堂兄弟 PE（proline-glutamic acid）和 PPE（proline-proline-glutamic acid）酶堂兄弟也共有存于非传染病的 NTM 之前。PE_PGRS（PE_polymorphic guanine-cytosine-rich sequence）酶亚堂兄弟则无论如何共有存于传染病的分枝芽孢之前，以外 M. leprae、M. marinum、M. ulcerans 以及 MTBC。MTBC 基因组内带有大量神经毒素 - 抗神经毒素管理系统RNA，这与另外的大肠芽孢形成鲜明对比。其之前的一些神经毒素 - 抗神经毒素管理系统已被证明在病症生物学之前的表多达有差异性。神经毒素 - 抗神经毒素管理系统与大肠芽孢的许多基本功能，以外RNA表多达催化反应、生宽相对速度和持留性有关，指明这些管理系统也许在 MTBC 的传染病上客串关键性反派。综上，尤其微生物学的结果证明，并不必从基因组上寻找造出也就是说的特点来暗示 MTBC 对药剂的毒意志力和传播者能意志力。1.2 与 Mycobacterium canettii 的尤其微生物学将 MTBC 生物学和 M. canettii 以及另外的柔软骨盆大肠芽孢（smooth tubercle bacilli， STB）积极开展基因组尤其，也可揭示 MTBC 作为专性大肠芽孢性的特点。STB 在遗传学家上和 MTBC 尤为比起（三幅 1a）。到现今为止，有数近 100 株 STB 被分离造出来，它们都来自南美。至今早已有 STB 人徒弟的确诊就有。研究团队对 STB 的流行起来病学即没多久如此知之甚不算。STB 在学龄前之前的传染病其实比的大。这都指明 STB 和自然环境前提条件大肠芽孢性的传染病特点相似。与 MTBC 生物学的基因组比起，STB 的基因组要大 10-115kb。生物学两者之在在的在大分子素质上的药剂内性愈发大。例如，MTBC 生物学彼此有达远达 2，000 个 SNP，而 STB 生物学则可远有达 65，000 个左右的 SNP。愈发为关键性的是，STB 的药剂内与 HGT 有关，但 MTBC 则没有人这一特点。这指明 STB 在形态上与其它分枝芽孢是相似的。对 MTBC、STB 以及 NTM 的基因组尤其推断，投身于维生素 B12 小分姪的RNA cobF 并不共有存于 MTBC，但是共有存于 STB 以及 NTM，如 M. marinum 和 M. kansasii 之前。这证明 MTBC 也许无法小分姪维生素 B12，只能从细杆菌之前所含。另一方面，MTBC 之前共有存一种与细杆菌自体调节涉及的酶 pe_pgrs33，但在 STB、M.marinum 和 M. kansasii 之前缺陷，这指明 MTBC 之前共有存与传染病涉及的RNA。已经有的研究成果证明，MTBC 之前共有存两个原件的聚酮合酶 pks5 RNA，这种RNA整合血案所致荚膜的巨大变化，这与生物学的毒意志力降更高有关。以上的尤其微生物学研究成果证明，MTBC 和许多其它的大肠芽孢性各不相同。一些大肠芽孢性的传染病可以与不算数的线粒体核群岛或毒意志力原核生物涉及联。但在 MTBC 之前，大肠芽孢毒意志力和传播者机制的重新考虑停滞性愈发为复杂，是多种因姪互为发挥作用的结果。另外，一些大肠芽孢因姪还和细杆菌因姪互为发挥作用，所致 MTBC 各不相同领导者不具备各不相同的细杆菌比如说、各不相同的细杆菌感染发挥和结果。胃癌分枝芽孢复合物的生物学和形态 -1三幅 1 生物学适于于的 MTBC 的亚太地区管理系统地理自然环境学。a. 基于基因组的 MTBC 以及 Mycobacterium canettii 的遗传学家形态果树。MTBC 以外 7 种适于于生物学的由此可知（彩色）和几种适于于各种野生和家狗爬虫类（蓝灰色）的由此可知。M. tuberculosis 特异性的缺陷（TBD1）共有存于 L2、L3 和 L4 由此可知的所有生物学基因组上。相似地，在可视主干下的生物学基因组上都缺陷差异性周边地区 RD7、RD8、RD9 或 RD10。灰色短斜线问到从来自玻利维亚的遗存埋葬之前回收的有达 1，000 之前的13世纪 MTBC 生物学的基因组。人口比例尺问到每个启动子的核苷酸取代数。 b.7 个主要适于于生物学的 MTBC 由此可知的亚太地区原产。2. 寄主取向与适于于MTBC 与其它大肠芽孢性各不相同，其它大肠芽孢性细杆菌感染第二细杆菌时，也许无论如何是大肠芽孢性贫困史之前的巧合溢造出血案，并不必在第二细杆菌上维持细杆菌感染。然而，当 MTBC 的起源于生物学形态为专性大肠芽孢性后，可有利于形态为适于于各种野生或家狗哺乳爬虫类以及生物学的各种由此可知（三幅 1a）。生物学肺胃癌主要由狭义上的胃癌分枝芽孢（M. tuberculosis sensu stricto）和南美分枝芽孢（M. africanum）激起。MTBC 之前可以适于于生物学的生物学可以有利于细分 7 个遗传学家由此可知。其之前 L1、L2、L3、L4 和 L7 科于 M. tuberculosis sensu stricto。L5 和 L6 一般被称为 M. africanum West Africa 1 和 M. africanum West Africa 2（三幅 1a）。这 7 种由此可知生物学发挥造出强大的管理系统地理自然环境性状骨架，其之前一些由此可知在亚太地区流行起来，而另一些则有强烈的地理自然环境限制（三幅 1b）。L2 和 L4 是亚太地区普遍性流行起来的由此可知，其之前 L2 主要在东亚占多数主导地位。L1 和 L3 主要在印度洋周围地区流行起来。L5 和 L6 的流行起来周边地区被限制在西非。而 L7 由此可知则完均均部在埃塞俄比亚被注意到。各种停滞性互为起发挥作用促成了适于于生物学的 MTBC 由此可知领导者的管理系统地理自然环境原产。在 MTBC 之前适于于爬虫类的生物学之前，有些早已被注意到，有些则是已经有才被注意到。值得一提的是适于于各不相同爬虫类的 MTBC 生物学的生物学、细杆菌比如说、形态以及它们与适于于生物学的 MTBC 生物学两者之在在的关连即没多久如此没有人被仔细统计分析探究。1896 年，在 Robert Koch 注意到可细杆菌感染生物学的胃癌分枝芽孢 14 年后，Theobald Smith 证明激发爬虫类肺胃癌的传染病因姪是与胃癌分枝芽孢各不相同的大肠芽孢——牛分枝芽孢（M. bovis）。想到为牛的杆菌类，M. bovis 也从许多哺乳爬虫类，以外生物学之前被分离造出来造出来。生物学也许无论如何是 M. bovis 的溢造出细杆菌，这是因营生物学肺胃癌之前只有 1 -3% 的确诊是由 M. bovis 和羊分枝芽孢（M. caprae）细杆菌感染而所致的，且这种肺胃癌大多人徒弟。另一方面，野生獾对 M. bovis 水平适合于，因此它也许是 M. bovis 的稳定细杆菌，代表了一个关键性的大肠芽孢托。其它适于于爬虫类的 MTBC 领导者以外 M. microti（细杆菌感染黑尾）、M. pinnipedii（细杆菌感染海豹和海狮）、M. orygis（细杆菌感染野猪）、M. mungi（细杆菌感染线状猫猫科动物）、M. suricattae（细杆菌感染猫猫科动物）、蹄狗芽孢（The dassie bacillus）以及大猩猩芽孢（The chimpanzee bacillus）。这些大肠芽孢性都是根据所分离造出来时的第一只爬虫类细杆菌所定名为的。这些由此可知两者之在在共有存深厚的遗传学家关连（三幅 1a），所以它们回事愈发适于作为 MTBC 之前的各不相同生物学改进型。另外，一些大肠芽孢的实际细杆菌仍不明确。仍要因为如此，重新考虑 MTBC 各不相同生物学细杆菌适用范围的原姪机制也不确实。在 M. microti、M. mungi 和蹄狗芽孢的基因组之前缺不算 RD1。RD1 可编码 ESX1 新陈代谢管理系统，是 M. tuberculosis sensu stricto 只不过毒意志力所须要的。RD1 的缺陷首次在 M. bovis 减毒疫苗 BCG 基因组之前被注意到，这一片段的缺陷与 BCG 的毒意志力减缓有关。据推论，RD1 在 M. microti、M. mungi 和蹄狗芽孢之前的缺陷最大限度它们对细杆菌的适于于性。因为这些大肠芽孢主要细杆菌感染贫困在拥挤自然环境之前的穴居爬虫类，不良的采光自然环境使得生物学的传播者愈发易，于是没多久不必须 RD1 所包括的毒意志力了。另一项研究成果则研究成果了双组分催化反应管理系统 PhoPR 的特异性环境因素，这一特异性在所有适于于爬虫类的生物学和适于于生物学的 L6 由此可知生物学之前都共有存。研究成果者注意到，这种特异性如果被复制到胃癌杆菌上将才会所致 PhoP 调节姪活性的下调，投身于大肠芽孢毒意志力的生物学活性脂质失掉以及 ESAT6 新陈代谢下降。以上RNA改进型如何所致 M. bovis 难以细杆菌感染生物学，研究成果技术人员现今仍不确实。相似地，M. tuberculosis sensu stricto 细杆菌感染牛时也发挥造出减毒特点，这种细杆菌比如说的原姪为基础研究成果技术人员也不确实。3. 适于于生物学的 MTBC 的起源于由于 M. bovis 不具备比 M. tuberculosis sensu stricto 愈发广泛应用的寄主适用范围，因此研究团队早先显然胃癌分枝芽孢是生物学在铁器一时期一时期期在在从绵羊之前赢得的。后来，大肠芽孢基因组基因组注意到 M. bovis 不具备比胃癌分枝芽孢愈发小的基因组，这证明胃癌分枝芽孢不太也许从 M. bovis 形态而来。一些研究成果证明，MTBC 各领导者的RNA取走先后顺序仍要符合生物学将肺胃癌病毒感染爬虫类的形态处理过程。尤其微生物学研究成果也默许这一说法，因为适于于生物学的 MTBC 比适于于爬虫类的领导者在遗传学家上愈发13世纪（三幅 1a）。早先的研究成果显然缺不算 RD7、RD8 和 RD10 的大肠芽孢群就是适于于爬虫类的 MTBC 领导者。但最新资料证明适于于爬虫类的 MTBC 可细分两个脱离的遗传学家主干（三幅 1a）。其之前一个主干内以外 M. bovis、M. caprae、M. orygis、M. pinnipedii 和 M. microti。另一个主干则以外 M. mungi、M. suricattae、蹄狗芽孢和大猩猩芽孢，这一主干的大肠芽孢和胃癌分枝芽孢 L6 由此可知拥有都由的起源于。在一些乍得，胃癌杆菌 L6 由此可知能所致高多达 50% 的生物学患上肺胃癌。由于 L6 由此可知与适于于爬虫类的 MTBC 生物学有深厚的遗传学家亲缘关连，因此研究团队传言 L6 由此可知的胃癌杆菌还拥有爬虫类细杆菌。然而，到现今为止早已注意到这类生物学的爬虫类细杆菌。考虑到 L6 由此可知胃癌杆菌的遗传学家位置（三幅 1a），它也许在形态处理过程之前发生了多次细杆菌激发态，从生物学跳到爬虫类然后先回到生物学。现今的论者显然适于于生物学的 MTBC 起源于于南美。第一，STB 被显然是 MTBC 亲缘关连已经有的大肠芽孢，它们完均均部在南美被分离造出来。第二，南美是唯一拥有所有 7 种适于于生物学的 MTBC 由此可知的中国（三幅 1b），并且这种中国上胃癌杆菌由此可知的丰富性随着与南美西南方的降更高而下降。第三，MTBC 均基因组基因组的各种管理系统地理自然环境学统计分析证明南美是最也许的起源于周边地区，并且还在南美注意到了可适于于大多数爬虫类、并可细杆菌感染珍稀的 MTBC 领导者（三幅 1a）。与其地理自然环境4. 适于于生物学的 MTBC 的生物学学一些适于于生物学的 MTBC 由此可知极不算造再次出现今某一地理自然环境周边地区内（三幅 1b），它们也许愈发喜欢细杆菌感染当地生物学。局部适于于是指适于于某种细杆菌的传染病在其它细杆菌之前传播者能意志力减缓的现像。这类胃癌杆菌也许就是对当地生物学积极开展了局部适于于。有数研究成果注意到，胃癌杆菌 L5 由此可知的传播者与病患上的种族涉及。另外，流行起来病学研究成果也注意到生物学肺胃癌的局部适于于现像。如，在大城市之前某些生物学之前却适当细杆菌感染来自某一地区的病患上。4.1 “人文学科”和“职业技能”从生物学学的比如说，原产适用范围受限的 MTBC 由此可知是可以细杆菌感染特定细杆菌的占多数占优势狭窄生物学位的职业技能。相反，原产广泛应用的 MTBC 由此可知则是可以占多数占优势多种生物学位的人文学科。MTBC L4 由此可知是亚太地区适用之内最常见的肺胃癌传染源。然而已经有的均基因组研究成果证明 L4 由此可知仍可被细分多个亚系（三幅 2a）。对来自 100 个国家所的 3，366 个 L4 由此可知病症分离造出来生物学积极开展RNA分改进型后注意到，某些亚系在亚太地区适用范围广泛应用原产，它们是人文学科，而其它亚系则是受地理自然环境限制的职业技能（三幅 2b）。有趣的是，尽管以外的 MTBC 上已知的生物学 T 线粒体表位是温和的，但是 L4 由此可知之前的人文学科亚系生物学的 T 线粒体表位不具备比职业技能生物学愈发大人口比例的可变性，这也许和多样的细杆菌适用范围和针对它们的自体逃逸机制涉及。在一些地区，人文学科改进型的 MTBC 生物学和职业技能改进型的生物学的交叉共有存并不排斥，停滞性也许是创会人物理现象（founder effects）和依赖于的群落移动性。研究团队显然职业技能改进型胃癌杆菌要比人文学科改进型生物学愈发13世纪，它们主要是没有人更多的整整和能意志力在亚太地区传播者。研究成果技术人员还必须积极开展有利于的基本功能研究成果，来确认各不相同由此可知胃癌杆菌适于于各不相同生物学细杆菌的主要停滞性无论如何是生物学还是社才会停滞性。4.2 适于于生物学的 MTBC 的毒意志力形态生物学肺胃癌的一个关键性特点是潜伏性，可以潜伏宽多达十年。先是，胃癌杆菌才会被细杆菌自体管理系统抑制，直至自体基本功能更高下时，才大量摄食所致药剂患病。研究团队显然 MTBC 生物学较晚适于于了以放牧营生的老年人，这样大肠芽孢性没多久可在潜伏十年后，在生物学心灵后半期患病，然后从细杆菌HIV传播者至自体意志力更高的新生儿。这样胃癌杆菌所面对的自然环境压意志力就小很多。根据生物学学概念预见，老年人电导率随着城市化不断增宽，与此同时增强了胃癌杆菌的毒意志力、变长了潜伏期。适于于各不相同生物学的 MTBC 由此可知在毒意志力、疾病演进以及传播者潜意志力等方面都共有存差异性，而这些环境因素差异性也许仍要与它们各不相同生物学细杆菌的人口人口比例巨大变化历史深厚涉及。另外，现今的资料推断老年人之前相尤其大量的潜伏细杆菌HIV，而肺胃癌确诊则不算得多，这指明胃癌杆菌的潜伏细杆菌感染也许是一种杆菌和药剂的共有生关连，在某种以往上对细杆菌有利。例如胃癌杆菌潜伏细杆菌感染可以给细杆菌包括自体刺激以保护细杆菌免受其它疾病的困扰，胃癌杆菌还可以给细杆菌包括关键性的纤量营养素。胃癌分枝芽孢复合物的生物学和形态 -2三幅 2 MTBC L4 由此可知可以细分职业技能生物学和人文学科生物学。a. 基于基因组的遗传学家推断 L4 可以有利于细细分至不算十个亚系。三角形问到对由此可知和亚前传之前的主干积极开展了卷曲，以提高放大。b.L4 由此可知之前的一些亚系在地理自然环境上容许，而其它亚系则原产在亚太地区适用之内（人文学科）。 总和问到在假定国家所之前该亚系在 L4 由此可知之前的人口比例。5. MTBC 生物学温和改进型基因组5.1 HGT 在 MTBC 之前理论上可忽略不计 HGT 究竟在 MTBC 病症生物学两者之在在发生，还是只共有存于 STB 和其它分枝芽孢生物学之前？对这一问题共有存争辩。迄今为止大多数结论都显然 HGT 在胃癌分枝芽孢之前未被检测到。对原产在 MTBC 生物学基因组上的小卫星移位基因组积极开展统计分析，注意到在各不相同生物学之前这些移位基因组是连锁的，没有人被RNA整合所破坏；用于积极开展 MTBC 生物学分改进型的基因组缺陷无同源性；用各不相同的原姪标记构建 MTBC 生物学的遗传学家果树，结果理论上一致；除了与抗病毒依赖性涉及的特异性趋同形态以外，另外的单核苷酸启动子的同源特异性并不引人注目。但已经有的研究成果向这一概念提议了考验，指造出 MTBC 生物学经常交换小 DNA 片段，但由于基因组药剂内依赖于，这些血案未被留意。总之，现有的实验显然 MTBC 是一类基因组温和的乔纳森姪小团体，HGT 大多在生物学在在发生。5.2 自然可选择和发挥改进型漂变两者之在在的平衡 MTBC 是一类基因组温和的大肠芽孢性，这对它们的原姪形态相尤其关键性的因素，特别是因素自然可选择和之前性形态（如随机发挥改进型漂变）两者之在在的平衡。在 MTBC 之前，可基本功能性牵连（selective sweeps）和氛围可选择（background selection）都由发挥作用所致发挥改进型丰富性下降。在可基本功能性牵连之前，仍要可选择的RNA座（例如耐药性特异性）才会所致整个线粒体核通过关联实现相同，丰富性下降。氛围可选择则是当有毒特异性造再次出现时，该RNA座涉及的所有线粒体核药剂内都被去除。MTBC 小团体发挥改进型学的一个特点是高人口比例的更高频药剂内，尤其是单体特异性（即极不算在一个生物学之前发生的特异性），这仍要是氛围可选择的结果。除此以外的是，更高频特异性的大肠芽孢在病患上肝线粒体也被保守可选择，这证明产物可选择和氛围可选择也许是病患上和 MTBC 共有形态的特点。一项研究成果了疗程期在在 MTBC 在药剂之前的性状巨大变化，注意到接受合理药品疗程的药剂之前胃癌杆菌的产物可选择接收机要强于接受次优的抗病毒疗程病患上之前的胃癌杆菌。总之，产物可选择其实是 MTBC 形态的一个关键性特点，并且这些大肠芽孢之前造再次出现的大多数新特异性也许是有毒的，这指明了了适于于生物学的 MTBC 仍未能较好地在生物学之前生存和传播者（三幅 3a）。5.3 性状困难、性状骨架以及发挥改进型漂移的因素除了产物可选择外，性状困难也才会所致胃癌杆菌丰富性的下降，因为每次 MTBC 细杆菌感染新细杆菌时，老病患上肝线粒体造再次出现的多数大肠芽孢药剂内都才会取走（三幅 3b）。此外，MTBC 的性状可细分各不相同亚群，这些各不相同亚群在同一细杆菌肝线粒体、在各不相同病患上背上，以及在各不相同的地理自然环境自然环境下都共有存（三幅 1b）。传播者困难、性状骨架和乔纳森性都才会所致合理性状影响力也下降。性状影响力也减小将所致较更高的自然可选择效率，随机发挥改进型漂移的因素也可视降更高。它在 MTBC 的形态之前起着关键性发挥作用。在 MTBC 之前有 2 / 3 的 SNP 亦然同义特异性，甚至已被生物学相同都已的 SNP。这些特异性可以因素可视RNA的基本功能。总之，明白因素胃癌杆菌形态的发挥作用，最大限度对 MTBC 的形态轨迹积极开展预见并对其积极开展合理的干预。胃癌分枝芽孢复合物的生物学和形态 -3三幅 3 自然可选择和发挥改进型漂变在 MTBC 形态和适合于性造再次出现之前的发挥作用。a.MTBC 在细杆菌内的形态特点是产物可选择。在病患上之前有一个占优势乔纳森，另外的多数特异性在传染时才会取走。大斑点问到主要的大肠芽孢乔纳森，小灰点代表重新特异性。b. 一些可所致肺部囊性角化的机才会传染病，如锇假单胞杆菌或伯克霍布罗氏杆菌，它们往往在形态处理过程之前是对生物学细杆菌的从头适于于，各不相同的大肠芽孢亚群在病患上之前可以分开形态。各不相同粉红色的暗斑代表各不相同的大肠芽孢亚群。c.MTBC 在每次传播者时碰见性状困难，这所致大肠芽孢丰富性下降、合理性状下降，并所致随机发挥改进型漂变对性状的因素降更高。各不相同粉红色的点代表在病患上肝线粒体形态造出的各不相同大肠芽孢特异性体，纤小指明各不相同生物学对细杆菌适于度的差异性。d. 在病患上疗程期在在，对胃癌杆菌降更高另外抗病毒后纤生物学的形态曲线。当给病患上的用药不必杀死 MTBC，病患上处于无效疗程时，MTBC 没多久有愈发大的也许赢得额外的依赖性特异性。本三幅推断，某病患上早先细杆菌感染了仍未对 7 种药品不具备依赖性的 MTBC 生物学。红点问到所细杆菌感染生物学之前的 100% 通过基因组病症都注意到了这 7 种药品的耐药性RNA。在停滞 5 年的疗程期在在，此病患上之前所细杆菌感染的大肠芽孢不断赢得对几种其它药品的依赖性，以外两种重新抗胃癌药品候选物 bedaquiline 和 delamanid（蓝色的药品 8 和红色的药品 9）。这些重新耐药性杆菌在病患上肝线粒体被相同都已。在此处理过程之前可以造再次出现多个脱离的耐药性杆菌亚群，其之前一些可以在病患上肝线粒体相同细杆菌感染，而其它的亚群则随着整整的演进被病患上取走（如，对药品 9 激发的耐药性杆菌则有 A 和则有 B）。e. 这些在病患上肝线粒体相同细杆菌感染的耐药性杆菌被成功传播者的也许性取决耐药性杆菌对自然环境的适于度以及特殊性。左上方斜线问到对自然环境适于度高，实线斜线问到对自然环境适于度更高。6. 药品抗性MDR-TB 和 XDR-TB 的造再次出现指明抗病毒对 MTBC 相尤其仍要可选择。在病症自然环境之前 MTBC 生物学的特异性率有达为每个基因组每年有 0.3-0.5 个DNA移除，这比大多数的病症大肠芽孢更高几个理论上。但是，尽管胃癌杆菌特异性率更高且考虑到 HGT 和依赖性原核生物，适合于性即没多久如此迅速就才会造再次出现（三幅 3d）。这是因为抗病毒耐药性特异性的增益与固有特异性率、耐药性RNA的纤小、耐药性特异性的适于于性物理现象和个肝线粒体大肠芽孢的性状纤小都有关连。对于疗程败北的病患上来说，肝线粒体大肠芽孢的性状也许并不大。耐药性RNA的纤小与耐药性机制有关，并因抗病毒各不相同而各不相同。以上驱动胃癌杆菌适合于性的停滞性很更容易被明白。比起，胃癌杆菌适合于性的生物学和形态即没多久如此必须研究成果。耐多药肺胃癌和广泛应用耐药性肺胃癌的亚太地区流行起来主要是由于耐药性生物学的激发和直接传播者（三幅 3c-e）。MTBC 之前耐药性RNA的特异性通常与无药品筛选前提条件时生物学适于度蒙受有一定保持联系，但是一些特异性的激发对生物学没有人降更高或大多降更高成本，那么这些特异性则被生物学适当可选择。此外，补偿特异性也可以解决问题与特定耐药性特异性涉及的初始缺陷（三幅 4）。例如，在利福平依赖性生物学之前， RNA 一氧化氮（RNAP）结构域之前的二次特异性可以以后生物学的转录活性，这种特异性降更高了耐药性杆菌的传播者能意志力，也有也许赢得额外的抗病毒抗性性。此外，对各不相同药品激发质子化而所致的耐药性特异性两者之在在不具备上位互为发挥作用，这将所致每个单独特异性的适于度蒙受减缓。仍要，生物学的发挥改进型氛围也可以因素耐药性捷径，同一特异性在各不相同的生物学上耐药性素质也许各不相同。作为 MTBC 由此可知 L2 的领导者，胃癌杆菌成都生物学堂兄弟（三幅 1a）和多药耐药性有关，但停滞性尚为不确实。究竟这一生物学相尤其愈发好的固有特异性率仍不确实。有研究成果显然这些生物学之所以赢得如此广泛应用的传播者也许是由于随机的发挥改进型漂变，也就是说，在确实的整整造再次出现今确实的外（三幅 3b）。也有一种也许，就是一些成都堂兄弟生物学的毒意志力和传播者能意志力较强，这样就有愈发多机才会激发适合于性，并愈发好地承担耐药性特异性的负担。总的来说，耐药性特异性、补偿性特异性以及生物学的发挥改进型氛围两者之在在的上位互为发挥作用都由因素耐药性肺胃癌的生物学学和流行起来病学（三幅 4）。当制订肺胃癌的新改进型疗程拟议时，助长对这种互为发挥作用的明白，将对提升胃癌杆菌的适合于性至关关键性。胃癌分枝芽孢复合物的生物学和形态 -4三幅 4 上位互为发挥作用在耐多药肺胃癌形态之前的发挥作用。7. 结论近些年来，虽然生物学肺胃癌的起源于、生物学学和形态研究成果仍未赢得了许多重新见解，但仍有许多工作要想到。MTBC 通过获取和取走RNA从一种自然环境生物学形态为专业知识大肠芽孢性。但在 MTBC 基因组之前并没有人一个也就是说特点（例如RNA或RNA特异性等）来暗示这一类生物学的专性传染病的贫困方式将以及各种 MTBC 由此可知对各不相同细杆菌的比如说。对这些各不相同的 MTBC 由此可知积极开展尤其研究成果，例如尤其它们的基因组、细杆菌比如说、传染病能意志力和传播者能意志力等，最大限度我们探究胃癌杆菌传染病、传播者能意志力和细杆菌重新考虑的停滞性，对新改进型抗病毒和疫苗的技术开发也有一定的促进发挥作用。适于于生物学的 MTBC 呈现造出特定的管理系统地理自然环境性状骨架，并且各不相同的由此可知相尤其各不相同的形态正向，有的形态为了职业技能，有的形态为了人文学科。但这一现像能否指明了 MTBC 的适于于性策略，还是无论如何是随机的创会物理现象，或无论如何是因为社才会停滞性即没多久如此不得而知。现今研究成果显然 MTBC 的性状之前所积极开展的 HGT 理论上可忽略不计。MTBC 的严谨乔纳森性、传播者困难以及性状骨架都才会因素自然可选择和随机发挥改进型漂移两者之在在的平衡，但我们仍必须有利于的研究成果来明白各不相同的形态意志力量在病患上内部和病患上两者之在在对生物学起发挥作用的方式将，以及各不相同的形态意志力量在胃癌杆菌上所起发挥作用与其它传染病的各不相同。仍要，耐药性特异性、补偿性特异性以及生物学的发挥改进型氛围两者之在在的上位互为发挥作用可都由因素耐药性肺胃癌的生物学学和形态。对这一现像的有利于研究成果，可借助探究它们耐药性杆菌激发之前的关键性性，以提升胃癌杆菌和其他大肠芽孢细杆菌感染的疗程拟议。